多吉扎寺，寧瑪派在西藏自治區的第一所大寺，被當做是“寧瑪派的祖庭”。它的全全名是土丹多吉扎寺，意為“佛家金鋼巖”。寺廟的創建者是扎西多吉，原是拉堆絳地區頭領，十六世紀末期被新起的辛廈巴·才旦多吉擊敗。他迫不得已帶領“艾旺教團”趕到山南、工布等地傳教士。1598年，他建立了多吉扎寺，專業弘傳“北藏”系統軟件的密法教典，追認“北藏”法祖師爺仁增廓德（歐珠堅參）為該寺第一世活佛。寺主以轉世活佛的方式世代相傳。
公年1643年，第四世仁美白瑪成烈接任后，在五世達賴喇嘛羅桑加措和德斯桑加措的大慈大悲關注和幫扶下，該寺的經營規模得到發展壯大并設立了顯密二種經院，眾僧達五百多人，第四世仁增打開了扎洋宗新圣洞。公年1717年，準噶部拆除了寺廟，殊不知來到護法神殿時，軍人突然去世了，因此部隊回到，之后，清朝康熙把準噶部逐出。七世達賴喇嘛走上金座后，在他一聲令下援助下，整修寺廟，第五世仁增格桑白瑪旺欠接任，他打開了昌果措朗圣洞，第六世仁增康松司暖、第七世仁增阿旺江白，他是藏醫上知名的、第八世仁增格桑白瑪旺吉、第九世仁增揚意多吉、這一世，第十世仁增加扎江白落桑在文化大革命前去到多吉扎寺接任。那時候經堂二十四根柱，后殿四根柱子、護法殿四根柱子，也有十幾個圣殿：法界城堡，法性城堡、勝乘城堡、銀靈塔堂、曲桑拉長、權怒層頂、大自在天的主圣堂，朗珍拉康等。圣殿里曾供有金銀制的各種各樣寶貴的佛、普薩、阿羅漢，喇嘛持明等佛象，靈塔堂里敬奉著每世多扎仁增活佛的黃金白銀靈塔，高寬比為四米，塔上鑲有金鋼裸鉆，十大粒天然珍珠、翡玉、藍色寶石、松石、紅珊瑚等各種各樣許多珍貴裝飾品。在雙層藏經樓里，用黃金白銀和高品質墨寫的甘珠爾、丹珠爾、傳略等為寶貴的新老派系的許多經卷。也有伏藏三師的伏藏佛象和經卷。荷花師的徒弟那朗多吉便覺和赤松德贊修習用的金剛橛、佛牙、致尊米拉日巴的拐仗、北主金鋼道童的繪像、五世達賴喇嘛的寶意唐卡，遍入出血唐卡等寶貴的各種各樣唐卡，跳神衣服褲子和兩張非常大的緞制佛象等。
文化大革命期內寺廟被毀。自1983年剛開始，在青海省紀委，地域行政部門和多扎仁增江白落桑的適用和佛信眾的協助下持續檢修成現如今的經營規模。
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